Он занимался подготовкой и проведением выборов депутатов Государственной Думы РФ шестого созыва. По итогам голосования «Единая Россия» в области набрала чуть более 29% голосов. Глава Правительства РФ Владимир Путин, отвечая на вопросы избирателей в ходе «прямой линии», посоветовал губернаторам, не обеспечившим высокий результат ЕР подумать, «не подать ли прошение об отставке».
Но вместо губернатора свой пост покидает Владимир Ковальчук. На должности первого заместителя он проработал почти четыре года. До этого времени работал в аппарате представителя президента в Уральском федеральном округе вместе с действующим губернатором Сергеем Вахруковым. Как сообщила ГТРК «Ярославия», Ковальчук намерен продолжить свою трудовую деятельность в столице.
Замгубернатора Ярославской области объяснил отставку состоянием здоровья 
Главный редактор ярославской телекомпании уволился из-за выборов 
Председатель областного совета профсоюзов уходит из облдумы