Как и сообщалось ранее, его подозревают в злоупотреблении должностными полномочиями.
По данным следствия, в рамках реализации областной целевой программы «Комплексный инвестиционный план модернизации городского поселения Ростов на 2010-2015 годы», между выступающей в качестве заказчика администрацией города в лице главы и ООО «Радострой», выступающим в качестве генерального подрядчика, был заключен муниципальный контракт на строительство сетей водоснабжения и хозяйственно-бытовой канализации в Ростове на сумму около 282 миллионов рублей.
А для технического надзора за исполнением муниципального контракта со стороны ООО «Радострой», администрация привлекла ООО «ГосСтрой», у которого нет специалистов по такому профилю. Компания никогда не осуществляла подобный надзор.
В период с августа по ноябрь 2012 года Юрий Бойко, зная, что в актах о приемке выполненных работ, представленных генеральным подрядчиком для производства их оплаты, содержались недостоверные сведения о фактически не производившихся объемах выполненных работ и затрат на них, распорядился перечислить подрядчику около 10 миллионов рублей.
Из-за этого строительство сетей водоснабжения и хозяйственно-бытовой канализации до настоящего времени не завершено, объекты в эксплуатацию не введены, а бюджету Ярославской области и бюджету Ростова причинен ущерб в размере 10 миллионов 650 тысяч рублей.